Integración Shopify y Holded: qué se sincroniza y qué no

Conectar Shopify con Holded es de lo primero que hace una tienda online cuando quiere dejar de pasar ventas a mano. La integración oficial se instala en una tarde y trae los pedidos, los productos y el stock. Lo que no te dice nadie al instalarla es que hay cosas que no cuadra por ti, y que son justo las que hacen que la contabilidad de un ecommerce no coincida con el banco. Esto es lo que se sincroniza solo, lo que no, y cómo dejarla bien configurada desde el primer día.

🔌 Qué hace la integración oficial

Holded tiene una integración propia con Shopify, que se instala desde la tienda de apps de Shopify y se configura en Holded. A fecha de octubre de 2026, según la documentación de Holded, sincroniza cuatro cosas, y todas se enlazan por el SKU de cada producto:

Dos detalles que conviene saber antes de empezar: al conectarla, las facturas entran en modo borrador hasta que las apruebes, y los productos que crees o cambies en Holded no viajan a Shopify. La ficha de producto manda en Shopify; Holded la recibe.

🧩 Las 4 cosas que la integración no cuadra por ti

La integración trae las ventas. Pero lo que entra en tu banco no son tus ventas, y ahí empieza el trabajo que sigue siendo manual.

1. Las liquidaciones de la pasarela y sus comisiones. Shopify Payments, PayPal o Stripe no te ingresan lo que vendes: te ingresan las ventas menos las devoluciones y menos sus comisiones, días después y agrupado. La integración crea las facturas de venta, pero el ingreso del banco hay que casarlo con esas ventas y registrar la comisión como gasto. Si no, el banco nunca cuadra y las comisiones (en torno al 2,5% de lo cobrado en una tienda de moda que llevamos) desaparecen de tu cuenta de resultados. El detalle, con un mes real, está en cómo contabilizar Shopify Payments.

2. Las facturas que te hace Shopify. La cuota de Shopify y las apps de pago llegan en facturas aparte. Son gastos de la tienda y hay que registrarlos como cualquier proveedor, con su tratamiento de IVA.

3. Los impuestos de las ventas fuera de España. Si vendes a consumidores de otros países de la UE y superas los 10.000 € al año, el IVA es el del país del cliente, y lo habitual es declararlo a través de la ventanilla única (OSS, modelo 369). La integración permite asignar impuestos específicos, pero alguien tiene que configurarlos bien y revisarlos. Lo explicamos en IVA OSS en ecommerce.

4. El stock de partida y los casos raros. La sincronización mueve el stock a partir de que la activas: el inventario que ya tenías hay que cuadrarlo una vez entre las dos plataformas. Y los productos sin SKU, los packs o los que llevan lotes o números de serie necesitan revisión aparte, porque es donde la sincronización suele fallar.

⚙️ Cómo configurarla bien desde el primer día

La mayoría de problemas no son de la integración, sino de una configuración hecha con prisa. Antes de aprobar la primera factura:

SKU en todos los productos, y únicos. Sin SKU no hay vínculo, y un SKU repetido mezcla dos productos. Revísalo en Shopify antes de conectar, porque es mucho más fácil corregirlo al principio.

Una serie de numeración propia para Shopify. Que las facturas de la tienda online vayan en su propia serie, separadas de las que emites a mano. Facilita revisar, cuadrar y separar los canales en los informes.

Cada método de pago, a su cuenta. La integración permite enlazar cada pasarela (Shopify Payments, PayPal, Stripe) con una cuenta de tesorería en Holded. Es lo que luego permite conciliar cada payout con sus ventas. Sin ese enlace, la conciliación se hace a ciegas.

Impuestos revisados con tu asesor. Tipos de IVA por producto, ventas a Canarias y a otros países de la UE. Una mala asignación aquí se repite en cada factura.

Corrección de decimales activada. Shopify y Holded redondean distinto, y sin esa opción aparecen diferencias de céntimos en muchas facturas.

Un mes en borrador. Deja el modo borrador el primer mes y compara: ventas de Shopify, facturas en Holded e ingresos en el banco. Cuando los tres cuadren, apruébalas en bloque y desactívalo.

🧰 Cómo lo llevamos nosotros

En Mouni somos Solution Partner de Holded. Con los clientes de ecommerce que llevamos sobre Shopify y Holded, la integración es el punto de partida, no el final: al arrancar revisamos SKU, series, métodos de pago e impuestos, y después conciliamos cada semana los payouts de la pasarela con sus ventas y comisiones, con la conciliación bancaria en Holded al día. Así el cierre de mes sale con las ventas, las comisiones y la caja cuadradas, y el margen por canal se puede mirar con datos reales.

❓ Preguntas rápidas

¿Holded se integra con Shopify? Sí. Holded tiene una integración oficial que importa los pedidos pagados como facturas o tickets, los productos con SKU y el stock, este último en los dos sentidos. Se instala desde la tienda de apps de Shopify y se configura en Holded.

¿La integración concilia los pagos de Shopify Payments? No de forma completa. Crea las facturas de venta y permite enlazar cada pasarela con una cuenta de tesorería, pero el ingreso en el banco llega neto de devoluciones y comisiones, y hay que casarlo con las ventas y registrar la comisión como gasto.

¿Los productos que creo en Holded pasan a Shopify? No. Los productos van solo de Shopify a Holded. El stock sí se sincroniza en los dos sentidos, si tienes el módulo de inventario activado.

¿Qué pasa con las devoluciones? Cuando hay un reembolso en Shopify, la integración genera una venta correctiva (una factura rectificativa) en Holded. El dinero devuelto, en cambio, se descuenta del siguiente payout de la pasarela, y eso hay que reflejarlo al conciliar.

Pablo Gil Diéguez

Founder de Mouni y CFO externo de marcas de ecommerce, agencias y SaaS en España. Cada semana publicamos una guía sin humo sobre finanzas y fiscalidad de negocios digitales.